Vila Botani memiliki kebun sendiri. Lebih dari setengah hektar lahan dimanfaatkan untuk kebun sayur organik. Kebanyakan sayur yang ditanam tumbuh sepanjang tahun seperti wortel, labu siam, kacang panjang, buncis, bayam, daun roket atau arugula, dan sayur-sayuran China (secim dan pak coy). Secara musiman, kami juga memanen tomat, daun bawang, berbagai sayuran untuk salad, jagung manis, kacang tanah, terong Medan, singkong beserta daunnya, dan masih banyak lagi jenisnya. Sewaktu-waktunya kami juga menanam padi organik.

Pertanian Vila Botani diurus oleh Pak Haji Agus, lelaki asal Cipanas, daerah pertanian terkenal di kawasan Puncak. Sejak 2011, Pak Haji Agus sudah menangani pertanian kami dengan sistem bagi hasil. Beliau mendapatkan keuntungan lebih besar setelah dipotong biaya kompos, benih dan gaji buruh tani. Kami hampir tidak pernah menggunakan mesin. Hasil kebun ditanam dan dipetik langsung oleh para pekerja lokal. Pak Haji sangat bangga pada sayur-sayuran hasil kebunnya.